Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf541Q0GGX2 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms