Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms