Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms