Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Siah1bQ06985 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms