Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Sh3bp2Q06649 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Sh3bp2Q06649 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Sh3bp2Q06649 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Sh3bp2Q06649 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp2Q06649 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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