Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms