Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms