Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.08□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms