Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctnnb1Q02248 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms