Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms