Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms