Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Pde1bQ01065 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Pde1bQ01065 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Pde1bQ01065 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Pde1bQ01065 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Pde1bQ01065 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Pde1bQ01065 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Pde1bQ01065 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Pde1bQ01065 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Pde1bQ01065 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Pde1bQ01065 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Pde1bQ01065 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Pde1bQ01065 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Pde1bQ01065 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Pde1bQ01065 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms