Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms