Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cds1P98191 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cds1P98191 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cds1P98191 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms