Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smn1P97801 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smn1P97801 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smn1P97801 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smn1P97801 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smn1P97801 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Smn1P97801 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smn1P97801 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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