Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms