Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmsP97355 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmsP97355 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmsP97355 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmsP97355 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmsP97355 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmsP97355 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmsP97355 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmsP97355 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SmsP97355 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmsP97355 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SmsP97355 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmsP97355 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmsP97355 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SmsP97355 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmsP97355 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmsP97355 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmsP97355 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmsP97355 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmsP97355 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmsP97355 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmsP97355 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmsP97355 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmsP97355 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmsP97355 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmsP97355 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmsP97355 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmsP97355 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmsP97355 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SmsP97355 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SmsP97355 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SmsP97355 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SmsP97355 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SmsP97355 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SmsP97355 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SmsP97355 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SmsP97355 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SmsP97355 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SmsP97355 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SmsP97355 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SmsP97355 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SmsP97355 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SmsP97355 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SmsP97355 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SmsP97355 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SmsP97355 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SmsP97355 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SmsP97355 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SmsP97355 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SmsP97355 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SmsP97355 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SmsP97355 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SmsP97355 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SmsP97355 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SmsP97355 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SmsP97355 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SmsP97355 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SmsP97355 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SmsP97355 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SmsP97355 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SmsP97355 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SmsP97355 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SmsP97355 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SmsP97355 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SmsP97355 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SmsP97355 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SmsP97355 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmsP97355 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmsP97355 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmsP97355 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmsP97355 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmsP97355 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SmsP97355 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmsP97355 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmsP97355 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmsP97355 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmsP97355 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmsP97355 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmsP97355 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmsP97355 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms