Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms