Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tubg1P83887 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms