Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

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Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms