Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chl1P70232 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chl1P70232 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chl1P70232 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chl1P70232 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chl1P70232 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms