Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CgnP59242 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CgnP59242 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CgnP59242 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CgnP59242 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CgnP59242 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CgnP59242 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CgnP59242 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CgnP59242 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CgnP59242 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CgnP59242 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CgnP59242 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CgnP59242 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CgnP59242 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CgnP59242 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CgnP59242 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CgnP59242 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CgnP59242 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CgnP59242 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CgnP59242 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CgnP59242 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CgnP59242 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CgnP59242 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CgnP59242 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CgnP59242 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CgnP59242 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CgnP59242 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CgnP59242 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CgnP59242 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CgnP59242 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CgnP59242 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CgnP59242 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CgnP59242 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CgnP59242 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CgnP59242 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CgnP59242 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CgnP59242 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CgnP59242 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CgnP59242 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CgnP59242 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CgnP59242 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CgnP59242 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CgnP59242 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CgnP59242 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CgnP59242 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CgnP59242 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CgnP59242 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CgnP59242 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CgnP59242 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CgnP59242 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CgnP59242 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CgnP59242 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CgnP59242 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CgnP59242 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CgnP59242 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CgnP59242 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CgnP59242 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CgnP59242 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CgnP59242 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CgnP59242 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CgnP59242 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CgnP59242 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CgnP59242 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CgnP59242 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CgnP59242 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CgnP59242 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CgnP59242 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CgnP59242 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CgnP59242 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CgnP59242 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CgnP59242 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CgnP59242 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CgnP59242 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CgnP59242 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CgnP59242 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CgnP59242 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CgnP59242 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CgnP59242 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CgnP59242 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CgnP59242 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CgnP59242 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CgnP59242 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CgnP59242 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CgnP59242 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CgnP59242 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CgnP59242 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CgnP59242 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CgnP59242 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CgnP59242 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CgnP59242 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CgnP59242 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CgnP59242 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CgnP59242 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CgnP59242 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CgnP59242 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CgnP59242 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CgnP59242 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CgnP59242 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CgnP59242 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CgnP59242 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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