Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nphp4P59240 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nphp4P59240 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nphp4P59240 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nphp4P59240 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nphp4P59240 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nphp4P59240 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nphp4P59240 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nphp4P59240 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nphp4P59240 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nphp4P59240 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nphp4P59240 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nphp4P59240 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nphp4P59240 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nphp4P59240 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nphp4P59240 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nphp4P59240 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nphp4P59240 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nphp4P59240 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nphp4P59240 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nphp4P59240 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nphp4P59240 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nphp4P59240 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nphp4P59240 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nphp4P59240 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nphp4P59240 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nphp4P59240 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nphp4P59240 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nphp4P59240 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nphp4P59240 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nphp4P59240 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nphp4P59240 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nphp4P59240 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nphp4P59240 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nphp4P59240 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nphp4P59240 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nphp4P59240 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nphp4P59240 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Nphp4P59240 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nphp4P59240 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms