Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
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Cldn18P56857 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Cldn18P56857 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn18P56857 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
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