Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf5P56477 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf5P56477 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf5P56477 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf5P56477 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Irf5P56477 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf5P56477 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Irf5P56477 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Irf5P56477 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Irf5P56477 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Irf5P56477 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf5P56477 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf5P56477 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf5P56477 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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