Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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