Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa11P50709 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa11P50709 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa11P50709 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa11P50709 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms