Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TspoP50637 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TspoP50637 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TspoP50637 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TspoP50637 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TspoP50637 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TspoP50637 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TspoP50637 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TspoP50637 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TspoP50637 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TspoP50637 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TspoP50637 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TspoP50637 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TspoP50637 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TspoP50637 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TspoP50637 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TspoP50637 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TspoP50637 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TspoP50637 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TspoP50637 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TspoP50637 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TspoP50637 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TspoP50637 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TspoP50637 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TspoP50637 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TspoP50637 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TspoP50637 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TspoP50637 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TspoP50637 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TspoP50637 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TspoP50637 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TspoP50637 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TspoP50637 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TspoP50637 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TspoP50637 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TspoP50637 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TspoP50637 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TspoP50637 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TspoP50637 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TspoP50637 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TspoP50637 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TspoP50637 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TspoP50637 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TspoP50637 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TspoP50637 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TspoP50637 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TspoP50637 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TspoP50637 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TspoP50637 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TspoP50637 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
TspoP50637 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TspoP50637 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TspoP50637 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
TspoP50637 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TspoP50637 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TspoP50637 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TspoP50637 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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