Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VdrP48281 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VdrP48281 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VdrP48281 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VdrP48281 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VdrP48281 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
VdrP48281 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
VdrP48281 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VdrP48281 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
VdrP48281 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VdrP48281 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VdrP48281 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VdrP48281 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VdrP48281 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
VdrP48281 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VdrP48281 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
VdrP48281 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VdrP48281 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VdrP48281 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
VdrP48281 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VdrP48281 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VdrP48281 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VdrP48281 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
VdrP48281 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VdrP48281 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VdrP48281 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VdrP48281 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VdrP48281 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VdrP48281 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VdrP48281 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
VdrP48281 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
VdrP48281 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
VdrP48281 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
VdrP48281 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
VdrP48281 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
VdrP48281 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VdrP48281 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
VdrP48281 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
VdrP48281 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VdrP48281 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VdrP48281 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VdrP48281 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
VdrP48281 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
VdrP48281 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VdrP48281 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
VdrP48281 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VdrP48281 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
VdrP48281 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VdrP48281 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VdrP48281 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VdrP48281 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VdrP48281 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VdrP48281 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VdrP48281 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VdrP48281 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VdrP48281 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VdrP48281 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VdrP48281 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
VdrP48281 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
VdrP48281 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
VdrP48281 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
VdrP48281 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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VdrP48281 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
VdrP48281 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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VdrP48281 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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VdrP48281 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
VdrP48281 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
VdrP48281 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
VdrP48281 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
VdrP48281 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
VdrP48281 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
VdrP48281 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
VdrP48281 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
VdrP48281 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
VdrP48281 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
VdrP48281 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
VdrP48281 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
VdrP48281 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
VdrP48281 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
VdrP48281 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
VdrP48281 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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