Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab11bP46638 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms