Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms