Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
VhlP40338 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
VhlP40338 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VhlP40338 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VhlP40338 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VhlP40338 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
VhlP40338 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VhlP40338 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VhlP40338 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VhlP40338 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
VhlP40338 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VhlP40338 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VhlP40338 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VhlP40338 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VhlP40338 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
VhlP40338 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
VhlP40338 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VhlP40338 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
VhlP40338 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VhlP40338 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VhlP40338 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VhlP40338 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
VhlP40338 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VhlP40338 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
VhlP40338 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
VhlP40338 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
VhlP40338 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VhlP40338 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
VhlP40338 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VhlP40338 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
VhlP40338 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VhlP40338 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VhlP40338 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
VhlP40338 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VhlP40338 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
VhlP40338 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
VhlP40338 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
VhlP40338 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
VhlP40338 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
VhlP40338 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
VhlP40338 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
VhlP40338 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
VhlP40338 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
VhlP40338 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VhlP40338 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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