Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtlP38585 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtlP38585 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtlP38585 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtlP38585 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtlP38585 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
TtlP38585 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
TtlP38585 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtlP38585 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtlP38585 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtlP38585 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtlP38585 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtlP38585 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtlP38585 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtlP38585 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtlP38585 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtlP38585 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtlP38585 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtlP38585 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtlP38585 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtlP38585 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtlP38585 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtlP38585 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtlP38585 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtlP38585 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtlP38585 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtlP38585 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtlP38585 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtlP38585 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtlP38585 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtlP38585 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtlP38585 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtlP38585 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtlP38585 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtlP38585 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtlP38585 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtlP38585 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtlP38585 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtlP38585 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtlP38585 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtlP38585 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtlP38585 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtlP38585 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TtlP38585 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TtlP38585 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtlP38585 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtlP38585 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtlP38585 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtlP38585 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtlP38585 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TtlP38585 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TtlP38585 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TtlP38585 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TtlP38585 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtlP38585 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtlP38585 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtlP38585 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtlP38585 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtlP38585 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtlP38585 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtlP38585 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtlP38585 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtlP38585 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtlP38585 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtlP38585 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtlP38585 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtlP38585 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtlP38585 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtlP38585 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtlP38585 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtlP38585 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtlP38585 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtlP38585 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtlP38585 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtlP38585 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtlP38585 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtlP38585 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtlP38585 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtlP38585 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtlP38585 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtlP38585 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtlP38585 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtlP38585 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtlP38585 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtlP38585 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtlP38585 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
TtlP38585 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
TtlP38585 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtlP38585 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtlP38585 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtlP38585 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtlP38585 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtlP38585 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
TtlP38585 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtlP38585 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtlP38585 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtlP38585 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtlP38585 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtlP38585 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtlP38585 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms