Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Hoxd10P28359 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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