Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb1P28230 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb1P28230 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb1P28230 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb1P28230 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb1P28230 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb1P28230 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb1P28230 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb1P28230 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb1P28230 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb1P28230 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb1P28230 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb1P28230 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb1P28230 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb1P28230 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb1P28230 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb1P28230 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb1P28230 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb1P28230 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb1P28230 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb1P28230 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb1P28230 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb1P28230 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb1P28230 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb1P28230 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb1P28230 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb1P28230 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb1P28230 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb1P28230 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb1P28230 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb1P28230 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gjb1P28230 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gjb1P28230 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gjb1P28230 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gjb1P28230 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gjb1P28230 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gjb1P28230 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms