Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PdgfraP26618 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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