Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd12P23812 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms