Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Ggta1P23336 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ggta1P23336 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ggta1P23336 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ggta1P23336 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ggta1P23336 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ggta1P23336 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ggta1P23336 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Ggta1P23336 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Ggta1P23336 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Ggta1P23336 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
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Ggta1P23336 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ggta1P23336 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Ggta1P23336 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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