Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms