Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RarbP22605 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RarbP22605 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RarbP22605 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RarbP22605 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RarbP22605 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RarbP22605 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RarbP22605 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RarbP22605 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RarbP22605 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RarbP22605 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RarbP22605 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RarbP22605 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RarbP22605 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RarbP22605 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RarbP22605 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RarbP22605 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RarbP22605 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RarbP22605 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RarbP22605 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RarbP22605 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RarbP22605 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RarbP22605 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RarbP22605 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RarbP22605 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RarbP22605 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RarbP22605 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RarbP22605 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RarbP22605 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RarbP22605 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RarbP22605 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RarbP22605 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RarbP22605 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RarbP22605 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RarbP22605 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RarbP22605 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RarbP22605 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RarbP22605 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RarbP22605 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RarbP22605 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RarbP22605 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RarbP22605 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RarbP22605 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RarbP22605 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RarbP22605 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RarbP22605 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RarbP22605 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RarbP22605 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RarbP22605 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RarbP22605 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RarbP22605 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RarbP22605 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RarbP22605 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RarbP22605 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RarbP22605 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RarbP22605 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RarbP22605 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RarbP22605 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RarbP22605 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RarbP22605 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RarbP22605 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RarbP22605 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RarbP22605 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RarbP22605 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RarbP22605 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RarbP22605 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RarbP22605 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RarbP22605 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RarbP22605 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RarbP22605 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RarbP22605 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RarbP22605 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RarbP22605 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RarbP22605 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RarbP22605 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RarbP22605 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RarbP22605 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RarbP22605 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RarbP22605 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RarbP22605 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RarbP22605 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RarbP22605 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RarbP22605 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RarbP22605 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RarbP22605 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RarbP22605 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RarbP22605 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RarbP22605 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RarbP22605 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RarbP22605 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RarbP22605 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RarbP22605 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RarbP22605 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RarbP22605 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RarbP22605 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RarbP22605 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RarbP22605 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RarbP22605 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RarbP22605 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RarbP22605 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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