Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim1P20664 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Gm8902-201ENSMUST00000174341 1096 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Gm29018-201ENSMUST00000188707 925 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim1P20664 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim1P20664 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim1P20664 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim1P20664 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Gm13658-201ENSMUST00000135329 929 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim1P20664 AC153529.1-201ENSMUST00000217818 370 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim1P20664 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prim1P20664 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms