Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms