Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P20040 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P20040 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P20040 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P20040 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P20040 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P20040 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P20040 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P20040 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P20040 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
P20040 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P20040 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P20040 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
P20040 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P20040 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P20040 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P20040 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P20040 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P20040 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P20040 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P20040 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P20040 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P20040 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P20040 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P20040 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P20040 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P20040 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P20040 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P20040 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P20040 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P20040 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P20040 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P20040 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P20040 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
P20040 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P20040 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P20040 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
P20040 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P20040 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P20040 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P20040 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P20040 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P20040 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P20040 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P20040 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P20040 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P20040 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P20040 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P20040 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P20040 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P20040 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P20040 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P20040 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P20040 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P20040 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P20040 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P20040 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P20040 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P20040 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P20040 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P20040 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P20040 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P20040 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P20040 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P20040 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P20040 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
P20040 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P20040 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P20040 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P20040 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P20040 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P20040 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P20040 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
P20040 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
P20040 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P20040 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
P20040 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P20040 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
P20040 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P20040 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P20040 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P20040 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P20040 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P20040 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P20040 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P20040 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P20040 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P20040 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P20040 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P20040 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P20040 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P20040 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P20040 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P20040 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P20040 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P20040 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P20040 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
P20040 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P20040 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
P20040 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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