Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18526 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18526 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18526 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18526 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18526 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18526 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18526 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18526 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18526 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18526 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18526 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18526 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18526 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18526 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18526 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18526 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18526 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18526 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18526 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18526 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18526 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18526 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18526 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18526 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18526 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P18526 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P18526 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P18526 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18526 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18526 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18526 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18526 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18526 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18526 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18526 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18526 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18526 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18526 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18526 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18526 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18526 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18526 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18526 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18526 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18526 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18526 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18526 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18526 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18526 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18526 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18526 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18526 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18526 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18526 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18526 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18526 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18526 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18526 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18526 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18526 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18526 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P18526 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18526 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P18526 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P18526 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18526 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18526 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P18526 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P18526 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18526 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P18526 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P18526 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18526 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P18526 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18526 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18526 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P18526 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18526 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18526 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18526 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18526 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18526 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18526 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18526 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18526 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18526 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18526 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18526 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18526 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18526 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18526 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18526 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18526 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18526 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18526 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18526 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18526 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18526 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18526 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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