Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PcnaP17918 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PcnaP17918 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PcnaP17918 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PcnaP17918 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PcnaP17918 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PcnaP17918 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PcnaP17918 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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