Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

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Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou4f1P17208 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms