Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms