Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms