Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm31135-202ENSMUST00000208946 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 AC123062.1-201ENSMUST00000221287 481 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 AC153646.1-201ENSMUST00000223229 1279 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Rps25-201ENSMUST00000080300 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Vmn1r223-201ENSMUST00000091719 1086 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm26724-201ENSMUST00000180434 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Serpina3a-202ENSMUST00000109965 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Ola1-203ENSMUST00000112055 1251 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm12696-201ENSMUST00000122361 905 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm43539-201ENSMUST00000196190 363 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 AC154361.1-201ENSMUST00000225694 745 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Olfr434-201ENSMUST00000076752 1056 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm15071-201ENSMUST00000118189 1366 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Ucp1-201ENSMUST00000034146 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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