Protein–RNA interactions for Protein: P07214

Sparc, SPARC, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SparcP07214 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SparcP07214 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SparcP07214 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SparcP07214 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SparcP07214 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SparcP07214 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SparcP07214 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SparcP07214 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SparcP07214 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SparcP07214 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SparcP07214 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SparcP07214 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SparcP07214 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SparcP07214 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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SparcP07214 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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SparcP07214 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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SparcP07214 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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SparcP07214 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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SparcP07214 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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SparcP07214 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SparcP07214 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SparcP07214 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SparcP07214 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SparcP07214 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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SparcP07214 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SparcP07214 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SparcP07214 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SparcP07214 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SparcP07214 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SparcP07214 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SparcP07214 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SparcP07214 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SparcP07214 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SparcP07214 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SparcP07214 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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SparcP07214 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SparcP07214 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SparcP07214 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SparcP07214 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SparcP07214 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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